Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MesdQ9ERE7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MesdQ9ERE7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms