Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms