Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfcp2Q9ERA0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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