Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dap3Q9ER88 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms