Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clstn2Q9ER65 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn2Q9ER65 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms