Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER41

Tor1b, Torsin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1bQ9ER41 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tor1bQ9ER41 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tor1bQ9ER41 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms