Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms