Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms