Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncQ9EPM5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SyncQ9EPM5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncQ9EPM5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncQ9EPM5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncQ9EPM5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncQ9EPM5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncQ9EPM5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncQ9EPM5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncQ9EPM5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncQ9EPM5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncQ9EPM5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms