Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clstn1Q9EPL2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms