Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms