Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCL2

Fam96a, MIP18 family protein FAM96A, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam96aQ9DCL2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Fam96aQ9DCL2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Fam96aQ9DCL2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Fam96aQ9DCL2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Fam96aQ9DCL2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam96aQ9DCL2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms