Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pak1ip1Q9DCE5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms