Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms