Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms