Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm9sf1Q9DBU0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf1Q9DBU0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms