Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smg9Q9DB90 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms