Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms