Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmbim4Q9DA39 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms