Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smco2Q9DA21 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms