Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cnot8Q9D8X5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms