Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erp27Q9D8U3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms