Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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