Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn22Q9D7U6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn22Q9D7U6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms