Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capns2Q9D7J7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms