Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Srp19Q9D7A6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms