Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf13Q9D777 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms