Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbe1Q9D6Y9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms