Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc52a3Q9D6X5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc52a3Q9D6X5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc52a3Q9D6X5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms