Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt34Q9D646 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt34Q9D646 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms