Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc81Q9D5W4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms