Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms