Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms