Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zcchc13Q9D548 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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