Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrameQ9D4Z5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms