Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rabl3Q9D4V7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabl3Q9D4V7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms