Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc83Q9D4V3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms