Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930564D02RikQ9D4S4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms