Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Efhd1Q9D4J1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms