Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms