Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubgcp4Q9D4F8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms