Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy3Q9D394 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms