Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrnp35Q9D384 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrnp35Q9D384 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms