Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms