Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc8bQ9D2D9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms