Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Trappc6bQ9D289 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Trappc6bQ9D289 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Trappc6bQ9D289 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Trappc6bQ9D289 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Trappc6bQ9D289 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Trappc6bQ9D289 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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