Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D1F3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms