Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ift27Q9D0P8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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