Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms