Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Zbed3Q9D0L1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed3Q9D0L1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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